分享一篇发表在Nature Chemistry上的文章，题目为“Profiling the proteome-wide selectivity of diverse electrophiles”，通讯作者是来自莱顿大学的Stephan Hacker教授，其研究方向是使用质谱法鉴定蛋白质组中共价抑制剂的靶蛋白。值得一提的是，作者列表中还包含了开发MSFragger的Nesvizhskii教授。

不直接靶向酶活位点的共价抑制剂主要限于靶向半胱氨酸残基的抑制剂。目前已经开发了几种探针来使用该技术监测其他氨基酸，并且存在更多的亲电试剂来修饰蛋白质。然而，缺乏对不同亲电试剂选择性的直接、全蛋白质组的比较。本文就为了解决这一问题，比较了含有不同反应基团的 56 种炔烃探针。

具体来说，以碘乙酰胺探针为例，本文的工作流程首先是通过炔基探针标记裂解液，然后通过轻/重标isoDTB进行Click，混合进行质谱检测，最后数据处理部分首先通过Open Search确定修饰质量，然后通过Massoffset确定氨基酸选择性，最后通过Close Search进行定量。

作者应用该工作流程一共进行了56种炔基探针的分析，发现了17种高选择性探针，可全局监测9种氨基酸，汇总成下图。

总的来说，本文就是为蛋白质标记和配体监测中的各种应用选择合适的亲电子试剂提供了宝贵的指南。

本文作者：YDP

责任编辑：LYC

DOI：10.1038/s41557-025-01902-z

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41557-025-01902-z