肽由于具有合成可及性和拟蛋白特性,正在成为一种有吸引力的生物分子构建块用于制造具有新兴特性和功能的人工仿生材料。最近,University of California – Merced的Andrea D. Merg课题组通过对新型多价肽大环(96mers)卷曲螺旋肽砖(coiled coil peptide tiles,CCPT)的设计、合成和表征,扩展了肽构建块的设计空间。
图片来源:J. Am. Chem. Soc.
CCPT包含多个由柔性连接体分隔的正交螺旋肽结构域,环化结构引起的约束作用赋予了CCPT引导卷曲螺旋形成的CCPT“边缘”结构域与其游离肽结合伴侣之间可编程、多向相互作用的能力。这些全合成的肽是通过天然化学连接和分选酶Sortase A介导的环化使用收敛合成策略组装而成。
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通过圆二色谱(CD)分析,揭示了螺旋稳定性的增加与环化和CCPT边缘的卷曲螺旋形成相关。
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通过尺寸排阻色谱(SEC)、高效液相色谱(HPLC)和荧光淬灭分析,对各种组装的CCPT复合物的进行了全面的生物物理表征,并证实了CCPT卷曲螺旋结构域与其设计的靶向游离肽伴侣之间的正交共定位。
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最后,利用分子动力学模拟(MD),为实验结果提供分子水平的见解,作为理解CCPT及其复合物结构动力学的支撑。模拟CCPT结构的MD分析揭示了CCPT在络合时的刚性化和扩展,即与设计的结合伴侣形成卷曲螺旋,并为指导未来几代CCPT的设计提供了见解。将CCPT添加到基于螺旋的构建块中,有可能通过解锁具有可设计分子间界面的新拓扑结构来扩展螺旋组装。
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原文标题:Coiled Coil Peptide Tiles (CCPTs): Expanding the Peptide Building Block Design with Multivalent Peptide Macrocycles
原文作者:Anthony R. Perez, Adekunle Adewole, Daphney Sihwa, Michael E. Colvin, and Andrea D. Merg*
https://doi.org/10.1021/jacs.4c09531