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【Nat. Chem. Biol.】青霉素结合蛋白型硫酯酶对小分子内酰胺的生物催化环化反应2024-02-20

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大环肽是一种用于化学工具和潜在治疗的有前景的支架。肽的大环化合成方法经常受到C末端差向异构化和低聚的阻碍,导致其应用难以扩展。虽然存在规避这一问题的化学策略,但它们通常需要特定的氨基酸存在于肽序列中。

有鉴于此,Purdue University的Elizabeth I. Parkinson报道了一种肽环化酶Ulm16,催化非核糖核酸肽从头到尾的大内酰胺化,Ulm16属于青霉素结合蛋白类硫酯酶,参与到Ulleungmycin A的生物合成。

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图片来源:Nat. Chem. Biol.

Ulm16有效地环化4至6个氨基酸的各种非天然肽,催化效率高达3×106 M−1 s−1。与之前报道的许多同源蛋白不同,Ulm16耐受多种C端和N端氨基酸。

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图片来源:Nat. Chem. Biol.

随后解析了Ulm16的晶体结构,以及其底物的建模和定点诱变,使这种广泛的底物范围性质在结构上进行了合理的解释。总之,Ulm16代表了一种用于生物催化生产大环肽的有前途的工具。

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图片来源:Nat. Chem. Biol.

原文标题:Biocatalytic cyclization of small macrolactams by a penicillin-binding protein-type thioesterase

原文作者:Zachary L. Budimir, Rishi S. Patel, Alyssa Eggly, Claudia N. Evans, Hannah M. Rondon-Cordero, Jessica J. Adams, Chittaranjan Das & Elizabeth I. Parkinson*

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41589-023-01495-z

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