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Chem. Asian J.:N-烷基链接头在基因编码库技术中的研究2022-05-03
康龙化成基因编码库技术平台(DELT)研发团队最近开发出了一系列将小分子文库成员与编码DNA寡核苷酸连接起来的新型N-烷基链接头。现有文献中仅报道过几种寡核苷酸链接头,而且绝大多数是以正向酰胺的链接方式,因此,在常规的DEL合成和生物筛选研究中,链接头的作用可能容易被忽略。

与标准酰胺链接头(通常由oligo-AOP-NH2构建)相比,N-烷基链接头不仅具有更好的化学结构稳定性,而且新开发出来的链接点能够提供更好的化学结构多样性。而且,在DEL合成中使用N-烷基链接头可以减少或者无需使用化学保护基团,每一个化学循环中产生的中间体产物可以直接用于下一个循环合成中。从而使用最少的化学转化步骤来完成DEL的合成过程(例如3步合成得到3个循环的DEL)以实现更高的合成效率。

另外,由于使用了比较少的对寡核苷酸有损害的化学反应,因此可以合成出更高质量的DEL。特别地,基于现有的酰胺链接头所设计、合成出来的基因编码化合物库由于受到聚乙二醇末端非对称化学结构的影响,可能会扭曲基因编码化合物库与靶标蛋白的结合作用,使得获得的筛选结果具有偏向性。新型N-烷基链接头可以帮助筛选出对靶标蛋白化学结构差异性小的结合物,从而助力新药研发。

文信息

N-Alkyl Linkers for DNA-Encoded Chemical Libraries

文章第一作者为康龙化成(宁波)科技发展有限公司化学研究员孙兆美。

Zhao-Mei Sun, Shao-Guang Yang, Li-Jun Xue, Jie Zhang, Ke-Xin Yang, Yun-Jin Hu

Chemistry – An Asian Journal

DOI: 10.1002/asia.202200016

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