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Sci. Adv. | 泛素是一种CO2结合蛋白2023-11-30
分享一篇发表在Science advances上的文章,其通讯作者是来自英国杜伦大学的Martin J. Cann教授和美国马里兰大学的David Fushman教授。Cann教授主要关注核苷酸介导的信号响应、CO2响应和防御蛋白功能等,Fushman教授则主要关注细胞内信号传导系统特别是泛素信号系统。

 

 

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CO2为一种常见的生物体相关的气体分子,然而此前只有少量研究发现了与CO2调节功能相关的蛋白。CO2除了被少数几种直接响应无机碳的蛋白识别外,还可以与血红蛋白等通过氨基的相互作用产生翻译后修饰。而此前,Cann教授组曾经证明了三乙基氧鎓离子能够捕捉CO2的同时,可以通过氨甲酰化作用在氨基上产生修饰,并成功鉴定了拟南芥中能够结合CO2的七种蛋白。后续的研究中,他们又注意到了一种潜在的CO2结合蛋白,UBQ1(Ub extension fusion protein)。由于泛素(Ub)在各个物种之间的保守性,作者猜测哺乳动物中Ub可能会结合CO2,并响应其变化而发挥一些功能。

 

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因此,本文中作者在体外将重组的人源Ub与NaHCO3或者NaH13CO3共孵育,随后使用TEO捕捉,并通过LC-MS/MS在K33和K48上发现了CO2或者13CO2修饰被TEO捕捉后的质量位移。进一步使用13C-NMR,发现164ppm处氨甲酰碳的特征峰信号随着NaH13CO3浓度增加而提高,而这一结构能在K6、K33、K48和K63上形成。作者进一步对比K63和K48响应CO2的效果,发现只有K48处的Ub缀合会在CO2浓度增加时受到到抑制,这也暗示了在CO2升高时Ub K48可能发挥功能。

 

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此前已知升高的CO2会抑制NF-κB介导的转录过程,但是并不知道其具体机制。作者猜测Ub可能在其中起调节作用,所以构建了使用荧光信号反映NF-κB转录活性的报告系统,并在正常5%CO2或者高水平10%CO2的培养条件下对比了正常和K48R突变Ub导致的转录影响。结果表明WT Ub在高CO2环境中会导致转录减少,而K48R突变能够抑制这一变化,但是K63R突变则无法改变这一变化。此外,他们还发现在高CO2的情况NF-κB相关的IκB蛋白的降解和p65和定位响应效果会在K48R突变时减少。这些结果说明Ub K48会和CO2结合,并会导致NF-κB通路的变化。

 

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总之,作者证明了泛素是一种CO2结合蛋白,并发现了Ub在响应CO2变化中的作用。
本文作者:MYZ
责任编辑:KLH
文章链接:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abi5507
原文引用:DOI:10.1126/sciadv.abi5507