分享一篇发表在Angewandte Chemie上的文章,文章标题是“Tuning Encodable Tetrazine Chemistry for Site-Specific Protein Bioorthogonal Ligations”,通讯作者是来自俄勒冈州立大学生物化学和生物物理学系的Ryan A. Mehl副教授,他的主要研究方向是遗传密码子扩展技术的开发和应用。

生物正交化学(Bioorthogonal Chemistry)是指能够在生物体系中进行而不干扰生物自身化学过程的化学反应。这种技术在蛋白质标记、药物递送和生物成像等领域具有重要应用。近年来,遗传密码子扩展技术的出现为生物正交化学提供了新的可能性。通过遗传密码子扩展技术,可以将非天然氨基酸(ncAA)插入到蛋白质中,从而实现对蛋白质的特异性修饰和标记。然而,传统的生物正交连接化学反应速率较慢,无法满足生理相关蛋白质浓度或细胞内蛋白质标记的需求。四嗪(Tetrazine, Tet)与反式环辛烯(TCO)之间的逆电子需求Diels-Alder(IEDDA)反应因其快速的反应速率而受到关注。这种反应速率可以达到102-106M-1S-1,远高于传统的生物正交反应。作者希望能够通过遗传密码子扩展技术,将含有四嗪基团的非天然氨基酸插入蛋白质中,用于后续实现快速的生物正交连接。


作者首先依据结构将Tet-ncAA分为Tet1-Tet4四类,并合成了这四类共计31种非天然氨基酸。随后作者将Tet-ncAA插入sfGFP的Asn150位点,并结合已有的Tet-ncAA表达系统在细菌中表达。通过检测荧光的产生并使用MS辅助评估不同种类Tet-ncAA的插入效率。结果显示Tet2-ncAA烷基衍生物编码效率高,但芳香基衍生物几乎无法编码。Tet3-ncAA烷基和芳香基衍生物均能编码,但芳香基衍生物的编码效率较低;Tet4-ncAA芳基衍生物编码效率高,而吡啶基衍生物虽反应速率快,但在蛋白质中稳定性较差。

随后作者检测了Tet-ncAA在插入蛋白后的反应效率和反应速度。对于反应效率,作者使用了mass-tag策略,将纯化的Tet-sfGFP150与5k-PEG-TCO反应后经凝胶电泳分离检测click的反应效率。结果显示绝大多数的Tet-ncAA在蛋白质上都能够高效地与TCO反应。在这些Tet-ncAA中,氟代苯基取代的ncAA反应速率最快,Tet4-3F-Ph和Tet4-3,5-diF-Ph的反应速率分别达到62×104 M-1S-1和84×104 M-1S-1。此外,作者还检测了Tet-ncAA的稳定性。在4°C下,所有的Tet-ncAA在8天内保持稳定;但是在室温下,芳基衍生物会迅速降解。相比之下,氟代苯基衍生物在室温下8天后仍保持70%以上的反应性。

最后作者在293T细胞中表达了Tet-ncAA插入的sfGFP,并通过流式细胞术验证了其与细胞穿透性染料sTCO-JF646的反应性。结果显示,Tet4-3F-Ph在细胞内表现出相对较高的标记效率和一致性。作者基于Tet4-3F-Ph结构开发出了Tet4-3,5-diF-Ph和Tet4-3,4,5-triF-Ph,反应速率更高,而且在室温下表现出优异的稳定性。

总之,作者系统研究了基于四嗪的非天然氨基酸Tet-ncAA的编码效率和与TCO的反应性,并开发出了两种反应速率较高的ncAA Tet4-3,5-diF-Ph和Tet4-3,4,5-triF-Ph,为生物正交化学领域提供了重要的工具。
本文作者:ZBY
责任编辑:TZS
DOI:10.1002/anie.202508922
原文链接:https://doi.org/10.1002/anie.202508922







