目前针对SARS-CoV-2先导化合物的开发策略主要包括靶向冠状病毒的结构或非结构蛋白的药物设计。刺突蛋白(S蛋白)分布在冠状病毒膜表面,当病毒侵染宿主细胞时,S蛋白上的受体结合域(RBD)能够介导病毒与宿主受体——血管紧张素转化酶2(ACE2)结合,促进病毒粒子与宿主细胞膜融合,完成病毒粒子入侵宿主细胞的过程。最新研究表明,宿主细胞表面的糖胺聚糖——硫酸乙酰肝素(HS)可作为辅助受体与RBD、ACE2形成三元复合物(RBD-HS-ACE2),调节病毒入侵宿主细胞的过程。

研究过程中,作者构建了SARS-CoV-2 RBD和SARS-CoV-2 Omicron BA.1 RBD药效团模型,并对包含所有取代结构的二糖数据库进行虚拟筛选,发现了两种与RBD具有高亲和力的二糖类先导化合物——LBJ-1与LBJ-2。在生理条件下进行动力学模拟后,发现LBJ-1与LBJ-2与RBD的结合位点位于RBD-HS-ACE2结合界面附近。此外,作者在筛选时发现,这两种二糖类先导化合物与白细胞介素1β(IL-1β)间存在较强的相互作用,与白细胞介素10(IL-10)间存在较弱的相互作用,推测其可能拥有抑制SARS-CoV-2入侵宿主细胞后细胞因子过度反应引发导致的炎症风暴的作用。

Binjie Li, Dr. Tianji Zhang, Prof. Dr. Jin-ping Li, Prof. Dr. Ming-jia Yu
ChemBioChem
DOI: 10.1002/cbic.202200461







